在运行初期膜截留过滤的作用主要依据实际孔隙，随时间的延长膜表面的凝胶层逐渐形成使膜截留作用增强、出水水质稳定。事实上，Pillay等学者的研究已证实可以控制运行条件，使凝胶层保持适宜的厚度，既满足出水要求，又防止不可逆污染。A、B两种膜组件形式对COD的去除率无明显影响，即使在运行至第40天二者不同膜组件形式的SMBR处理蛋白废水的特性研究，HRT相差4h左右时，B种膜组件形式的出水反而好于A种膜组件形式，宁波废气处理说明可以通过膜组件形式的改进提高膜通量，同时又不影响膜出水。
    反应器对TN、TP的去除效果及分析在试验运行两周后，分别对A、B两种膜组件形式下的生物反应器中的总氮（TN）、总磷（TP）、浊度（NTU）的去除情况进行了测定。Qin为进水TN的质量浓度，Qup为上清液TN的质量浓度，Qout为出水TN的质量浓度，U为TN的总去除率。从表1可见A、B两种膜组件形式对TN的去除效果差异不明显。膜生物反应器中TN的去除效果，出水TP质量浓度为3.28.4mg/L，波动比较大。在A种膜组件形式下，有时膜出水的TP值甚至高于进水的TP值。推测是由于A种膜组件形式易造成端头污染，致使中空纤维间悬浮污泥的聚积导致厌氧条件下磷的释放。A、B两种膜组件形式对TP的去除率，B种的效果略好于A种。
    膜组件形式的改进对磷的去除有积极影响。另外，从物料平衡的角度分析，由于反应器体积较小，每天取1L混合液对除磷也起到一定的作用。进水浊度的为280400NTU；A、B两种膜组件形式的SMBR对浊度的去除率均达98%以上，说明SMBR能有效的去除浊度。值得提出的是本试验应用的污水是中等浓度的有机蛋白废水，国内外有关MBR处理生活污水的报导较多。